След.: Содержание 
|
|
Александр Николаевич Горбань Рем Григорьевич Хлебопрос ДЕМОН ДАРВИНА. Идея оптимальности и естественный отбор Москва: Наука (гл ред. физ.-мат. литературы), 1988 |
Наконец-то идея наследования как
разделения времен
овладевает биологами! Как раз через 20 лет после публикации "Демона",
в “CELL” вышел обзор "Timescales of Genetic and Epigenetic Inheritance"
(Временные шкалы генетической и
эпигенетической наследственности, читать ЗДЕСЬ!). NEW! Статья
о
биохимии эпигенетической наследственности:
Vardhman
K.
Rakyan,
Jost
Preis,
Hugh
D.
Morgan
And
Emma
Whitelaw,
The
marks,
mechanisms
and
memory
of
epigenetic
states
in
mammals,
Biochem.
J.
(2001) 356, 1-10 ЗДЕСЬ.
Ее русская аннотация ЗДЕСЬ. NEW! ЗДЕСЬ
популярный
обзор: В.В. Хлебович, Новое окно в эпигенетику, Природа,
№ 7, 2006. ЗДЕСЬ
современная статья из Functional Ecology
2007 о материнском эффекте и
эволюции на экологических временах. (Все как в "Демоне"!) А ЗДЕСЬ
обсуждаются наследуемые
единицы (через 12 лет после выхода
"Демона"). NEW! Как определить
наследование? Этот вопрос возникает опять и опять всякий раз после
серьезных открытий. ЗДЕСЬ – статья
М.Д. Голубовского, одного из авторов концепции
«динамического наследования»: М.Д. Голубовский,
Неканонические наследственные изменения, Природа, №
8-9, 2001 г. NEW!
И опять: статья «Что такое
ген?» в одном из главных генетических журналов мира. Mark
B. Gerstein, Can Bruce, Joel S. Rozowsky, Deyou Zheng, Jiang Du, Jan O. Korbel, Olof Emanuelsson, Zhengdong D.
Zhang, Sherman Weissman and Michael Snyder, What is a gene, post-ENCODE? History and updated definition,
Genome
Res.
2007
17: 669-681. Все время возвращаемся к проблеме, решенной в «Демоне»:
Наследование без организмов -
попытка определения. NEW!
Интересно, что по
мнению Никиты Николаевича Моисеева, "Демон Дарвина" - “лучшая книга по
математическому моделированию, написанная в ХХ-м
веке” (Из книги: Александр
Лейфер РАЗГАДАТЬ ЗАМЫСЕЛ БОГА…
расширенная
цитата ТУТ) |
Сайт “теория эволюции как она есть” -
самые различные материалы, посвященные теории биологической
эволюции.
Содержание
ПРЕДИСЛОВИЕ: МИФ О МОДЕЛИРОВАНИИ
ПЕРВЫЙ ШАГ
Естественное и искусственное. Мир Эпиметея. У кого больше потомков - у мухи или у слона? Единая мера совершенства. Застывшая история. Царство матемазавров. Две ветви теории эволюции: возможен ли синтез? Проект читателя. Искусство сомневаться. Сомнения в принятом центральном тезисе. Вид с высоты, его достоинства и недостатки.
Отделение смысла от бессмыслицы. Теория - модель - объект. Теория Дарвина и динамические модели Ньютона. Закон шага и закон цели. Эволюционные сценарии в физике и биологии. Достаточны ли первые принципы? Теория или метод? Вложение возможных миров. Логическое всеведение. Неосуществимые программы дают полезные результаты. Определение как автопортрет. Проблема синтеза.
Восемь разновидностей моделей. Парадоксы и презумпция осмысленности. Незавершенные миры развивающейся физики. Рамка для неизвестных возможностей и в ней - Чебурашка. Простота без упрощений. Мысленный эксперимент - столкновение знаний. Имитационные модели. Две функции моделей: соответствие объектам и смыслообразование. Эффект зайца. Неужели физику легче, чем биологу? Проект двух следующих шагов.
Дарвинизм - картина мира в биологии. Биосфера и ее генотень. Проблема организма. Триединая среда. Расстояние между генотипами. Иерархичность генотени. Радиус скрещивания и брачные предпочтения у дрозофилы. Динамическое объяснение иерархичности. Проблемы происхождения высших таксонов. Восстановление истории и вымирания динозавров. Сама модель. Что иерархично?
Краб из Плимутской бухты. Цвет бабочки и промышленная революция. Запрограммированные случайности в фенотипе. Легенда о скромном хищнике. Парадокс выгоды. Решающий эксперимент по внедрению. Три типа устойчивости и оптимальности. Смысл ``пользы''. Альтруизм и динамика меток ``свой - чужой''. Проблема пола. Таинственные законы корреляции. Модели и реальность.
Открытие и переоткрытие. Развертывание простых моделей. Хромосома, локус, аллель и ген. Половое размножение и гены-грубияны. Размножение и отбор генов. Геноценоз как биоценоз и биоценоз как геноценоз. Благо рецессивности.
Идея инварианта. Встречные пути. Четыре подразделения клеточной ДНК. Генетический ламаркизм. Единицы воспроизводства. Динамическая последовательность. Единицы функции. Способности и поведение. Плата за функцию. Обобщенный генотип. От наследуемых единиц к биосфере и обратно. Коэффициент размножения без предков ипотомков. Сооптимальность и совершенство. Гены, полученные не от родителей. Где же организмы? Наследование без организмов - попытка определения.
Изменение и разнообразие. Проблема нейтральных мутаций. Мозаичность условий и волны жизни. Релятивизация наследуемых единиц, шаг первый. Эволюция, безразличная к деталям изменчивости. Направленные и ненаправленные изменения. Релятивизация, шаг второй. Эволюция изменчивости.
ГДЕ ЖЕ ГЛАВНАЯ МОДЕЛЬ?
КОММЕНТАРИИ К СПИСКУ ЛИТЕРАТУРЫ
Литература
Дополнительная литература
Книга: Горбань
и Карлин, Инвариантные многообразия в
физической и химической кинетике
Lect. Notes Phys. 660, Springer, 2005.
NEW!
Книга: Главные многообразия для визуализации и анализа данных, А. Горбань, Б. Кегль, Д. Вунш, А. Зиновьев (ред.), Lect. Notes Comp. Sc. Eng. 58, Springer, 2007.